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太古の地層から発掘された未知の物質”メダル”を使い、
人類は意志を持った小型ロボット『メダロット』を完成させた。
そんなメダロット同士を戦わせる「ロボトル」が子供から大人まで大流行。
主人公アガタヒカルも、愛犬ボナパルトが拾ってきたメダルを組み込んだ
「メタビー」とお友達になり、ロボトルを繰り広げるのであった！