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高校3年生になった弓樹真弥は、1年前にセレスティアで春儚たちと共に戦った記憶を失い、普通の男子高校生として暮らしていた。そんなある日、彼の前に逢儚と名乗る謎の少女が現れる。彼女は自身が新たなる「救世の巫女」だと語り、セレスティアのみならず地球にも危機が迫っていると告げる。かつての記憶を取り戻した真弥は、2つの世界を守るため再び戦うことを決意するが、そこに唯一無二の親友である榊山涼平が立ちふさがるのだった。