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素人ながらアニメについての情熱なら誰にも負けないと自負する兄沢命斗は、ふとしたきっかけで、アニメショップチェーン「アニメイト」池袋本店の店長を務めることになる。他店のアニメ店長と協力したり、時に対決したりしながら、店長としての実績を積んでいく兄沢。ある時、未来からやって来た「アニメイト」の社員を自称するワタルに、衝撃的な事実を告げられた。

そこで兄沢は、自分たちの存在、そしてアニメの未来を守るために、150年後の世界へとタイムスリップする。